FR901464 ถูกใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเซลล์มะเร็ง โดยเฉพาะในด้านการยับยั้งการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการแพร่กระจายของเซลล์มะเร็ง สารนี้มีศักยภาพในการเป็นตัวยับยั้งการสังเคราะห์โปรตีนที่ผิดปกติ ซึ่งอาจนำไปสู่การพัฒนายาใหม่สำหรับรักษาโรคมะเร็ง นอกจากนี้ยังมีการศึกษาถึงบทบาทของ FR901464 ในการควบคุมกระบวนการทางชีวภาพอื่นๆ เช่น การตอบสนองต่อความเครียดของเซลล์และการตายของเซลล์ตามธรรมชาติ (Apoptosis) ซึ่งเป็นกระบวนการสำคัญในการรักษาสมดุลของร่างกาย