PTC-209 HBr ถูกนำมาใช้ในการวิจัยด้านมะเร็ง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการศึกษาการยับยั้งโปรตีน BMI-1 ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมเซลล์ต้นกำเนิดมะเร็งและกระบวนการเกิดมะเร็ง การยับยั้ง BMI-1 โดย PTC-209 HBr ช่วยลดความสามารถของเซลล์มะเร็งในการเติบโตและแพร่กระจาย ทำให้เป็นเป้าหมายที่มีศักยภาพในการพัฒนายาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการใช้สารนี้เพื่อทำความเข้าใจกลไกการทำงานของเซลล์ต้นกำเนิดมะเร็งและผลกระทบต่อการรักษาโรคมะเร็งในระยะยาว