WYE-687 dihydrochloride ถูกใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์ PI3K (Phosphoinositide 3-kinase) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในกระบวนการส่งสัญญาณภายในเซลล์ โดยเฉพาะในด้านการเจริญเติบโตและการอยู่รอดของเซลล์ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อทดสอบประสิทธิภาพในการยับยั้ง PI3K และประเมินผลกระทบต่อเซลล์มะเร็ง เนื่องจาก PI3K มักถูกพบว่ามีกิจกรรมผิดปกติในโรคมะเร็งหลายชนิด นอกจากนี้ WYE-687 dihydrochloride ยังถูกใช้เพื่อพัฒนายาใหม่ๆ ที่อาจช่วยในการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการทำงานผิดปกติของ PI3K เช่น มะเร็งและโรคทางเมตาบอลิซึม การศึกษาด้วยสารนี้ช่วยให้นักวิจัยเข้าใจกลไกการทำงานของ PI3K ได้ลึกซึ้งขึ้น และเป็นแนวทางในการออกแบบยาที่มีประสิทธิภาพมากขึ้นในอนาคต