กลูตาราลดีไฮด์ใช้เป็นสารฆ่าเชื้อที่มีประสิทธิภาพสูงในทางการแพทย์ ทันตกรรม และอุตสาหกรรม สามารถทำลายแบคทีเรีย ไวรัส และเชื้อราได้อย่างมีประสิทธิภาพ ใช้ในการทำความสะอาดและฆ่าเชื้อเครื่องมือแพทย์ เช่น กล้องส่องภายในและอุปกรณ์ผ่าตัด ในระบบน้ำหล่อเย็น ใช้ควบคุมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารยึดเกาะในห้องปฏิบัติการฮิสโทโลยีและพยาธิวิทยา รวมถึงน้ำยาดองศพ เพื่อรักษาเนื้อเยื่อทางชีวภาพและป้องกันการสลายตัว ในอุตสาหกรรม ใช้ในกระบวนการฟอกหนัง ผลิตกระดาษ และสิ่งทอ เพื่อปรับปรุงความทนทานและคุณสมบัติของวัสดุ