เบนซิลคาร์บาเซตถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะรีเอเจนต์สำหรับการป้องกันหมู่คาร์บอนิล โดยทำปฏิกิริยากับอัลดีไฮด์และคีโตนเพื่อสร้างไฮดราซอน ซึ่งเป็นสารกลางที่เสถียรและสามารถแปลงกลับเป็นสารประกอบคาร์บอนิลเดิมได้ภายใต้สภาวะอ่อนโยน คุณสมบัตินี้ทำให้มีคุณค่าต่อกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งช่วยในการผลิตโมเลกุลที่ซับซ้อน

นอกจากนี้ เบนซิลคาร์บาเซตยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอโรไซคลิกต่าง ๆ ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายา สารเคมีเกษตร และสีย้อม ความสามารถในการสร้างอนุพันธ์ที่เสถียรกับสารประกอบคาร์บอนิลยังทำให้มีประโยชน์ในเคมีวิเคราะห์สำหรับการตรวจจับและการวัดปริมาณอัลดีไฮด์และคีโตน

さらに เบนซิลคาร์บาเซตถูกนำมาใช้ในการเตรียมวัสดุพอลิเมอร์ โดยทำหน้าที่เป็นสารเชื่อมขวางหรือสารปรับแต่งเพื่อเพิ่มคุณสมบัติของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในแอปพลิเคชันเคมีที่หลากหลาย