YKL-5-124 ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเป็นตัวยับยั้งที่แรงและเลือกเฉพาะของ cyclin-dependent kinase 7 (CDK7) การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในการศึกษาการควบคุมวัฏจักรเซลล์และกระบวนการถอดรหัส เนื่องจาก CDK7 มีบทบาทสำคัญในทั้งสองกระบวนการ นักวิจัยใช้ YKL-5-124 เพื่อตรวจสอบผลกระทบของการยับยั้ง CDK7 ต่อการเพิ่มจำนวนเซลล์มะเร็ง เนื่องจาก CDK7 มักจะทำงานมากเกินไปในมะเร็งต่างๆ โดยการบล็อก CDK7 สารประกอบนี้ช่วยในการทำความเข้าใจกลไกการเจริญเติบโตของเนื้องอกและระบุเป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้ นอกจากนี้ YKL-5-124 ยังถูกใช้เพื่อสำรวจผลกระทบต่อการถอดรหัสที่ไกล่เกลี่ยโดย RNA polymerase II ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการควบคุมการแสดงออกของยีน ความจำเพาะของมันทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการแยกแยะบทบาทที่ซับซ้อนของ CDK7 ในกระบวนการเซลล์และสำหรับการพัฒนาการบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมาย