CDK9-IN-1 ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษาบทบาทของ cyclin-dependent kinase 9 (CDK9) ในกระบวนการเซลล์ต่างๆ มันเป็นตัวยับยั้ง CDK9 ที่แรงและเลือกสรร ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าในการตรวจสอบการควบคุมการถอดรไว้ว โดยเฉพาะในบริบทของมะเร็งและการติดเชื้อไวรัส นักวิจัยใช้ CDK9-IN-1 เพื่อสำรวจผลกระทบต่อการยืดการถอดรไว้วที่ขึ้นกับ RNA polymerase II ซึ่งสำคัญสำหรับการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการรอดชีวิตของเซลล์ นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาที่มุ่งเข้าใจกลไกของ CDK9 ในโรคเช่น HIV ซึ่ง CDK9 มีบทบาทในการสืบพันธุ์ของไวรัส โดยการยับยั้ง CDK9 สารประกอบนี้ช่วยในการชี้แจงกลยุทธ์การรักษาที่เป็นไปได้สำหรับการกำหนดเป้าหมายเส้นทางที่ขึ้นกับ CDK9 ในมะเร็งและโรคไวรัส