วิตามินดี2 ใช้ในการรักษาและป้องกันโรคขาดวิตามินดี เช่น โรคกระดูกอ่อนหรือโรคกระดูกเปราะบาง โดยเฉพาะในผู้ที่ได้รับแสงแดดไม่เพียงพอหรือมีปัญหาในการดูดซึมวิตามินดีจากอาหาร วิตามินดี2 ช่วยส่งเสริมการดูดซึมแคลเซียมและฟอสฟอรัสในลำไส้ ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างและรักษาสุขภาพของกระดูกและฟัน นอกจากนี้ยังใช้ในผู้ป่วยโรคไตเรื้อรังที่ไม่สามารถสร้างวิตามินดีในรูปที่ใช้งานได้เอง รวมถึงใช้ร่วมกับการรักษาโรคพาราไธรอยด์บางชนิดที่มีผลต่อระดับแคลเซียมในเลือด