Rabeprazole sodium ใช้หลักในการยับยั้ง proton pump เพื่อลดการผลิตกรดในกระเพาะอาหาร มักสั่งจ่ายเพื่อรักษาโรคกรดไหลย้อน (GERD) ซึ่งกรดจากกระเพาะไหลย้อนขึ้นไปยังหลอดอาหาร ทำให้เกิดอาการแสบร้อนกลางอกและความเสียหาย ยังช่วยในการรักษาและป้องกันแผลในกระเพาะอาหารและลำไส้เล็ก ซึ่งมักเกิดจากการใช้ยา NSAIDs นานๆ หรือการติดเชื้อ Helicobacter pylori นอกจากนี้ ใช้ในการรักษากลุ่มอาการ Zollinger-Ellison ซึ่งเป็นภาวะหายากที่กระเพาะผลิตกรดมากเกินไป Rabeprazole sodium มักใช้ร่วมกับยาปฏิชีวนะเพื่อกำจัดเชื้อ H. pylori ลดความเสี่ยงแผลกำเริบ คุณสมบัติยับยั้งกรดเร็วและยาวนานทำให้เป็นตัวเลือกที่น่าเชื่อถือสำหรับจัดการโรคที่เกี่ยวข้องกับกรด