ไซเคลนเป็นสารเคลตติ้งเอเจนต์ที่ใช้อย่างกว้างขวางในด้านการถ่ายภาพทางการแพทย์ โดยเฉพาะการถ่ายภาพด้วยคลื่นแม่เหล็ก (MRI) มันก่อตัวเป็นคอมเพล็กซ์ที่เสถียรกับไอออนแกรโดลิเนียม ซึ่งใช้เป็นสารคอนทราสต์เพื่อเพิ่มความชัดเจนของโครงสร้างภายในในสแกน MRI การประยุกต์นี้สำคัญสำหรับการวินิจฉัยโรคต่างๆ รวมถึงเนื้องอก การอักเสบ และโรคหลอดเลือด นอกจากนี้ อนุพันธ์ของไซเคลนยังใช้ในการพัฒนารังสีเภสัชภัณฑ์สำหรับการบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมาย โดยช่วยส่งไอโซโทปกัมมันตภาพรังสีตรงไปยังเซลล์มะเร็ง ในงานวิจัย ไซเคลนยังใช้ในเคมีซูเปอร์โมเลกุลเพื่อสร้างโครงสร้างโมเลกุลซับซ้อนและศึกษาการโต้ตอบโฮสต์-เกสต์ ความสามารถในการจับไอออนโลหะทำให้มีคุณค่าในด้านการเร่งปฏิกิริยาและการประยุกต์ด้านสิ่งแวดล้อม เช่น การแยกและกู้คืนไอออนโลหะจากของเสียอุตสาหกรรม