Trans-2-methylcyclohexanamine hydrochloride ใช้หลัก ๆ ในเคมีอินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างแบบ chiral มันมักถูกใช้ในการเตรียมเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบที่มี stereochemistry เฉพาะ ความเป็น chiral ของสารนี้ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์ยาที่บริสุทธิ์แบบ enantiomer ซึ่งสำคัญสำหรับการรับประกันประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียง นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางในการผลิต agrochemicals ซึ่ง stereochemistry ที่แม่นยำสามารถเพิ่มกิจกรรมและ selectivity ของผลิตภัณฑ์สุดท้าย การประยุกต์ใช้ขยายไปยังห้องปฏิบัติการวิจัย ที่ใช้ในการศึกษาการสังเคราะห์แบบ asymmetric และพัฒนาวิธีการเร่งปฏิกิริยาใหม่ ๆ