(1R,3R)-3-Aminocyclohexanol hydrochloride ใช้ในด้านการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพและยาใหม่ๆ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มเอมีนและแอลกอฮอล์ ทำให้เหมาะสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของยา นอกจากนี้ยังอาจใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ ที่มีความสำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม เช่น การผลิตยาต้านเชื้อแบคทีเรียหรือยาที่มีผลต่อระบบประสาทส่วนกลาง