1-Chlorononane ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตสารลดแรงตึงผิวและสารซักฟอก โครงสร้างโซ่ไฮโดรคาร์บอนยาวทำให้เหมาะสำหรับการสร้างสารที่ลดแรงตึงผิว เพิ่มคุณสมบัติการทำความสะอาดของสูตรต่างๆ นอกจากนี้ ยังเป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนมากขึ้น รวมถึงยาและสารเคมีเกษตร ในงานวิจัย ใช้เป็นตัวทำละลายหรือสารเคมีในปฏิกิริยาเคมี เนื่องจากคุณสมบัตินอนโพลาร์ที่ช่วยละลายสารที่กลัวน้ำ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่สาขาวิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ซึ่งใช้ในการปรับเปลี่ยนโพลิเมอร์และการเตรียมสารเคลือบพิเศษ