ไอโซโพรพิลคลอโรฟอร์เมตใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับการนำกลุ่มปกป้องไอโซโพรพิลออกซี่คาร์บอนิล (isopropyloxycarbonyl) เข้ามา โดยเฉพาะมีคุณค่ามากในเคมีเปปไทด์ ซึ่งช่วยปกป้องกลุ่มอะมิโนระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์เพื่อป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางในการผลิตยา สารเคมีเกษตร และสารเคมีละเอียดอื่นๆ ความตอบสนองต่อแอลกอฮอล์และอะมีนทำให้มีประโยชน์สำหรับปฏิกิริยาเอสเทอร์และอะไมด์ ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ในบางกรณี ยังใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์และสารเคลือบ โดยทำหน้าที่เป็นสารเชื่อมขวางเพื่อเพิ่มคุณสมบัติของวัสดุ เนื่องจากไวต่อน้ำสูง จึงต้องใช้ด้วยความระมัดระวังในสภาพแวดล้อมที่ควบคุม