ใช้หลักๆ เป็นสาร derivatizing agent ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์และการวิเคราะห์กรดอะมิโน โดยนำเสนอกลุ่มปกป้อง 9-fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) ให้กับหมู่อะมีน ช่วยให้สามารถปกป้องหมู่อะมิโนได้อย่างเลือกสรรในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน คุณสมบัติการดูดซับรังสี UV ที่แรงและการเรืองแสงช่วยให้ตรวจจับได้อย่างอ่อนไหวใน HPLC และ capillary electrophoresis โดยเฉพาะสำหรับการวิเคราะห์ร่องรอยของอะมีนปฐมภูมิและทุติยภูมิ ใช้อย่างแพร่หลายในงานควบคุมคุณภาพยา การตรวจสอบอะมีนชีวภาพในอาหาร และการติดฉลากโมเลกุลชีวภาพสำหรับการตรวจวิเคราะห์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและในกระบวนการสังเคราะห์แบบเฟสตายตัว เนื่องจากกลุ่ม Fmoc มีความเสถียรและสามารถกำจัดได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน