ใช้ในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารต้านการอักเสบและสารต้านจุลชีพ หมู่ไตรฟลูออร์เมทอกซีช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบยา นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมของเหลวผลึกและเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ เนื่องจากโครงสร้างคอนจูเกตและคุณสมบัติดึงอิเล็กตรอน นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในยาฆ่าแมลงและสารเคมีเกษตรเพื่อปรับปรุงกิจกรรมกำจัดวัชพืชและกำจัดศัตรูพืช