โคบอลต์(II) ซิเตรต ไฮเดรต ใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารสัตว์เป็นอาหารเสริมเพื่อให้แน่ใจในระดับโคบอลต์ที่เหมาะสม ซึ่งจำเป็นสำหรับการสังเคราะห์วิตามินบี12 ในสัตว์ที่เคี้ยวเอื้อง ในสาขาการแพทย์ ใช้เป็นแหล่งโคบอลต์ในการปรุงยาบางชนิดและอาหารเสริมโภชนาการ เพื่อแก้ไขการขาดโคบอลต์ในมนุษย์ นอกจากนี้ ยังใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเป็นสารเคมีเพื่อศึกษาบทบาทของโคบอลต์ในระบบชีวภาพและปฏิกิริยากับสารประกอบอื่นๆ ในสถานที่อุตสาหกรรม ใช้ในการผลิตตัวเร่งปฏิกิริยาและเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์วัสดุที่ขึ้นอยู่กับโคบอลต์สำหรับกระบวนการเคมีต่างๆ