ไนเตรตทองแดงใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบและวัสดุที่มีทองแดงเป็นส่วนประกอบอื่นๆ ทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหรือสารเคมีในกระบวนการแปลงสารอินทรีย์ต่างๆ รวมถึงปฏิกิริยาออกซิเดชันและกระบวนการจับคู่ ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ ใช้ในการเตรียมฟิล์มบางของออกไซด์ทองแดงและอนุภาคนาโน ซึ่งมี ứng dụng ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ เซ็นเซอร์ และเซลล์แสงอาทิตย์ นอกจากนี้ ยังใช้ในอ่างชุบไฟฟ้าเพื่อสะสมชั้นเคลือบทองแดงบนพื้นผิว เพิ่มความนำไฟฟ้าและความต้านทานการกัดกร่อน ไนเตรตทองแดงยังใช้ในการย้อมผ้าทอเป็นสารมอร์แดนต์เพื่อยึดสี และในการผลิตเม็ดสีและสารกำจัดเชื้อรา