Hydrocortisone cypionate ใช้เป็นยาสเตียรอยด์ในการรักษาอาการอักเสบและอาการแพ้ต่าง ๆ มักใช้เพื่อลดอาการบวม แดง คัน และระคายเคืองที่เกิดจากผิวหนังอักเสบ เช่น โรคผิวหนังอักเสบจากภูมิแพ้ (atopic dermatitis) หรือโรคสะเก็ดเงิน (psoriasis) นอกจากนี้ยังสามารถใช้ในการรักษาอาการอักเสบของข้อต่อและกล้ามเนื้อ รวมถึงภาวะต่อมหมวกไตทำงานน้อย (adrenal insufficiency) เพื่อทดแทนฮอร์โมนคอร์ติซอลที่ร่างกายผลิตไม่เพียงพอ ยานี้มีประสิทธิภาพในการควบคุมการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันและลดการอักเสบได้อย่างมีประสิทธิภาพ