ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านการอักเสบหรือสารปรับการทำงานของระบบฮอร์โมน โครงสร้างไซโคลเฮกเซนที่มีหมู่คลอโรฟีนิลและหมู่อัลกอฮอล์ทำให้มีความเป็นขั้วและรูปร่างเฉพาะตัว ซึ่งช่วยในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพได้ดี เหมาะสำหรับการปรับแต่งโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพหรือลดผลข้างเคียงในโมเลกุลยา