ไอโซฟลูเพรโดนถูกใช้หลักๆ ในยาสัตว์เป็นคอร์ติโคสเตียรอยด์เพื่อจัดการการอักเสบและปฏิกิริยาแพ้ในสัตว์ มักให้เพื่อลดอาการบวม คัน และความไม่สบายที่เกี่ยวข้องกับภาวะผิวหนัง ข้ออักเสบ และความผิดปกติจากการอักเสบอื่นๆ ในปศุสัตว์และสัตว์เลี้ยง นอกจากนี้ยังมีประสิทธิภาพในการรักษาปัญหาการหายใจในสัตว์โดยการลดการอักเสบในทางเดินหายใจ คุณสมบัติต้านการอักเสบทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าตในการดูแลหลังการผ่าตัดเพื่อลดความเจ็บปวดและส่งเสริมการหายบาดแผล ไอโซฟลูเพรโดนยังถูกใช้ในการจัดการโรคภูมิต้านตนเองในสัตว์ ช่วยควบคุมการตอบสนองของภูมิคุ้มกันที่มากเกินไปซึ่งอาจทำลายเนื้อเยื่อ การใช้งานถูกตรวจสอบอย่างระมัดระวังเพื่อหลีกเลี่ยงผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้น เพื่อให้มั่นใจในสุขภาพและความเป็นอยู่ที่ดีของสัตว์ที่ได้รับการรักษา