BOC-Oxyma ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะสารเชื่อมโยง (coupling reagent) โดยช่วยในการก่อตัวของพันธะอะไมด์ระหว่างกรดอะมิโน เพิ่มประสิทธิภาพและลดการเกิดเรคเคมีเซชัน (racemization) การประยุกต์ใช้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งช่วยให้ได้ผลผลิตสูงและความบริสุทธิ์ของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยเภสัชกรรมและการพัฒนายา BOC-Oxyma ยังถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการเอสเทอร์ริฟิเคชันและปฏิกิริยาเชื่อมโยงอื่นๆ ทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายในห้องปฏิบัติการเคมี BOC-Oxyma มีความเสถียรและปลอดภัยในการใช้งาน จึงเป็นที่นิยมในงานวิจัยและอุตสาหกรรมเภสัชกรรม