DNP-PEG3-DNP ใช้ในงาน bioconjugation และการวิจัยทางชีววิทยาเคมี โดยทำหน้าที่เป็น crosslinker สำหรับการปรับเปลี่ยน biomolecules เช่น โปรตีน เปปไทด์ และกรดนิวคลีอิก กลุ่ม DNP (dinitrophenyl) สองกลุ่มช่วยให้เกิดปฏิสัมพันธ์เฉพาะกับแอนติบอดีหรือตัวรับ ทำให้มีคุณค่าใน immunoassays และระบบการส่งยาแบบ targeted PEG3 spacer ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและลด steric hindrance ซึ่งปรับปรุงประสิทธิภาพการจับคู่ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษา molecular interactions การ targeting เซลล์ และพัฒนาเครื่องมือวินิจฉัย