DiD triflate ถูกใช้อย่างแพร่หลายในฐานะสารติดฉลากฟลูออเรสเซนต์ในงานวิจัยทางชีววิทยา โดยเฉพาะสำหรับการย้อมสีและติดตามเยื่อหุ้มเซลล์ คุณสมบัติที่ชอบไขมันของมันช่วยให้สามารถรวมเข้ากับเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้เหมาะสำหรับการติดตามเซลล์ระยะยาวและการศึกษาการถ่ายภาพ

สารนี้ถูกใช้อย่างทั่วไปในกล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนต์และ flow cytometry เพื่อตรวจสอบการเคลื่อนที่ การเพิ่มจำนวน และปฏิสัมพันธ์ของเซลล์ในขั้นตอนทดสอบเซลล์ที่มีชีวิต นอกจากนี้ DiD triflate ยังถูกใช้ในงานทดลองการถ่ายภาพหลายสี เนื่องจากการปล่อยแสงในช่วง far-red ซึ่งลดการรบกวนจาก autofluorescence และช่วยให้การถ่ายภาพเนื้อเยื่อลึกได้

ความเสถียรและความเป็นพิษต่ำทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าสำหรับการศึกษา in vitro และ in vivo รวมถึงการติดตามเซลล์มะเร็งและการทำแผนที่เซลล์ประสาท