Cy7, SE ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีววิทยาและทางการแพทย์สำหรับการติดฉลากโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน เปปไทด์ แอนติบอดี และกรดนิวคลีอิก คุณสมบัติการเรืองแสงใกล้อินฟราเรดทำให้เหมาะสำหรับการถ่ายภาพในร่างกาย (in vivo imaging) ซึ่งช่วยให้ทะลุทะลวงเนื้อเยื่อลึกและรบกวนพื้นหลังน้อย สีนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการติดตามกระบวนการเซลล์ การกำหนดเป้าหมายเนื้องอก และการตรวจสอบระบบการส่งยา นอกจากนี้ ยังใช้ในกล้องจุลทรรศน์เรืองแสงและ flow cytometry สำหรับการตรวจจับและวิเคราะห์ที่ละเอียดอ่อน Cy7, SE ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาการทดสอบวินิจฉัยและเซ็นเซอร์ชีวภาพ เนื่องจากมีความเสถียรสูงและความสว่าง