คริปโตไซยานีนถูกนำมาใช้เป็นหลักในเทคโนโลยีเลเซอร์ โดยทำหน้าที่เป็นสีย้อมในเลเซอร์สีย้อม (dye lasers) เพื่อสร้างคลื่นแสงความยาวเฉพาะ นอกจากนี้ยังใช้ในระบบเก็บข้อมูลเชิงแสง เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการเขียนและอ่านข้อมูล นอกจากนั้นยังนำไปใช้ในภาพถ่ายทางการแพทย์ชีวภาพ เพื่อช่วยในการแสดงภาพโครงสร้างและหน้าที่ของเซลล์ ในโฟโตไดนามิกเทอราพี (Photodynamic Therapy) มันทำหน้าที่เป็นสารกระตุ้นแสง (photosensitizer) เพื่อกำหนดเป้าหมายและทำลายเซลล์มะเร็งเมื่อถูกกระตุ้นด้วยแสง นอกจากนี้ยังมีบทบาทในออปติกแบบไม่เชิงเส้น รวมถึงการเพิ่มความถี่สองเท่า (frequency doubling) และการจำกัดแสงเชิงออปติก (optical limiting) ซึ่งช่วยพัฒนาระบบสื่อสารเชิงแสง คริปโตไซยานีนยังถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการถ่ายภาพ โดยเฉพาะกระบวนการถ่ายภาพอินฟราเรด เนื่องจากมีความสามารถในการดูดซับแสงในช่วงคลื่นที่เหมาะสม ทำให้เป็นสารสำคัญในการสร้างฟิล์มถ่ายภาพที่ไวต่อแสงอินฟราเรด