ไมโครซิสติน-YR ถูกใช้ในการศึกษาด้านพิษวิทยาและสิ่งแวดล้อมเพื่อประเมินผลกระทบของสารพิษที่ผลิตโดยสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินที่มีต่อระบบนิเวศและสุขภาพมนุษย์ มันมักถูกนำมาใช้เป็นตัวชี้วัดในการตรวจสอบคุณภาพน้ำ โดยเฉพาะในแหล่งน้ำที่มีการเจริญเติบโตของสาหร่ายที่เป็นพิษ นอกจากนี้ ไมโครซิสติน-YR ยังถูกใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของสารพิษในร่างกาย และพัฒนาวิธีการตรวจวัดหรือกำจัดสารพิษเหล่านี้จากสิ่งแวดล้อม