เมทิลไซโคลบิวเทนคาร์บ็อกซิเลตใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตยาและสารเคมีละเอียด โครงสร้างวงแหวนไซโคลบิวเทนที่ไม่เหมือนใครทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติ steric และ electronic เฉพาะ ในเคมียารักษา มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายาตัวสมัคร โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาทหรือเส้นทางต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการสร้างสารประกอบที่มี bioactivity ที่เพิ่มขึ้น หน้าที่เอสเตอร์ของมันยังช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม ทำให้มีความยืดหยุ่นในกระบวนการวิจัยและอุตสาหกรรมต่าง ๆ