3,3-Difluorocyclobutanecarboxamide เป็นสารประกอบที่มีโครงสร้างเฉพาะตัว โดยถูกนำไปใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี ในเภสัชกรรม สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่างๆ โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคเมแทบอลิซึม แหวนไซโคลบิวเทนที่ถูกไดฟลูออไรด์ช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของยาสุดท้าย ในเกษตรเคมี สารนี้ถูกใช้ในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชขั้นสูง ซึ่งโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความปลอดภัยต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจการนำไปใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุเพื่อสร้างโพลิเมอร์เฉพาะทางที่มีความต้านทานความร้อนและสารเคมีสูงขึ้น