ใช้หลักในการห่อหุ้มโมเลกุล เคมีนี้มีประสิทธิภาพในการก่อตัวคอมเพล็กซ์การรวมตัวกับโมเลกุลอินทรีย์ต่างๆ เพิ่มการละลายและความเสถียรในสารละลายน้ำ พบการใช้งานในระบบนำส่งยา ซึ่งช่วยเพิ่ม bioavailability ของยาที่ละลายน้ำได้ยาก นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อมเพื่อกำจัดสารมลพิษอินทรีย์จากน้ำโดยการดักจับไว้ในโครงสร้างโมเลกุลของมัน ในการวิจัย ใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาการโต้ตอบโมเลกุลและเคมี host-guest ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับพฤติกรรมของระบบเคมีซับซ้อน อะตอมไอโอดีนยังทำให้มีประโยชน์ในการถ่ายภาพและการวินิจฉัย ทำหน้าที่เป็นสารคอนทราสต์ในเทคนิคการถ่ายภาพทางการแพทย์