Heptakis(6-iodo-6-deoxy)-β-cyclodextrin ใช้หลักในการเคมีซูเปอร์โมเลกุลเนื่องจากสามารถสร้างสารประกอบรวมกับโมเลกุลผู้มาเยือนต่างๆ ได้ โครงสร้างที่ถูกแทนที่ด้วยไอโอดีนช่วยเพิ่มความถี่ในการจับและความเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการศึกษาการรับรู้โมเลกุล สารนี้มักใช้ในการพัฒนาเซ็นเซอร์และการทดสอบ ซึ่งช่วยตรวจจับโมเลกุลเฉพาะโดยการห่อหุ้มไว้ในโพรงของมัน นอกจากนี้ยังใช้ในระบบขนส่งยาเพื่อปรับปรุงความละลายและความเสถียรของยาที่ละลายน้ำได้ยาก คุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ยังทำให้เป็นผู้สมัครสำหรับใช้ในเทคโนโลยีการแยก เช่น โครมาโทกราฟี ซึ่งช่วยในการแยกสารประกอบอย่างเลือกสรรตามขนาดและขั้ว