4-Aminocyclohexanecarbonitrile hydrochloride ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหลักในการผลิตยาต้านอาการซึมเศร้าและยาต้านความวิตกกังวลบางชนิด นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยทางเคมีอินทรีย์สำหรับการเตรียมอนุพันธ์ไซโคลเฮกเซน รูปแบบ hydrochloride ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลาย ทำให้เหมาะสมสำหรับปฏิกิริยาเคมีและการปรุงสูตรต่าง ๆ