ซิส-1,3-ไซโคลเฮกเซนไดออล ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการผลิตโพลิเมอร์และเรซิน โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยพื้นฐานในการสร้างวัสดุที่มีคุณสมบัติเชิงกลและความร้อนเฉพาะตัว ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มันทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนายาที่มีประสิทธิภาพและความเสถียรที่ดีขึ้น นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการปรุงสูตรสารเคมีพิเศษ เช่น กาวและสารเคลือบผิว ซึ่งความสามารถในการเกิดปฏิกิริยาและการละลายมีบทบาทสำคัญ การประยุกต์ใช้งานยังขยายไปสู่สาขาเคมีเกษตร โดยถูกใช้ในการผลิตยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเข้ากันได้กับสิ่งแวดล้อม