ไซโคลเฮกเซนคาร์บอนิไทรล์ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตสารกลางสำหรับส่วนประกอบยาสำคัญที่ใช้งานได้ (APIs) มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสร้างสารประกอบที่มีคุณสมบัติบำบัด เช่น ยาต้านการอักเสบและยาต้านไวรัส

ในอุตสาหกรรมสารเคมีเกษตร มันถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับสารประกอบที่ปกป้องพืชผลจากศัตรูพืชและวัชพืช โครงสร้างทางเคมีของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์ทางการเกษตรเหล่านี้

นอกจากนี้ ไซโคลเฮกเซนคาร์บอนิไทรล์ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยใช้ในการเตรียมสารประกอบอินทรีย์ต่างๆ รวมถึงสีย้อม เรซิน และสารเคมีพิเศษ กลุ่มนิไทรล์ของมันทำให้เป็นรีเอเจนต์ที่หลากหลายสำหรับการนำกลุ่มฟังก์ชันเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย

ในการวิจัยและพัฒนา มันถูกใช้เป็นตัวทำละลายหรือรีเอเจนต์ในปฏิกิริยาเคมี ช่วยในการศึกษากลไกปฏิกิริยาและการสังเคราะห์สารประกอบใหม่ ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าทั้งในห้องปฏิบัติการทางวิชาการและอุตสาหกรรม