ฟลูออโรไซโคลเพนเทนใช้หลักๆ เป็นสารทำความเย็นในระบบหล่อเย็นต่างๆ เนื่องจากมีจุดเดือดต่ำและคุณสมบัติทางอุณหพลศาสตร์ที่ดี รวมถึงไม่เป็นอันตรายต่อชั้นโอโซน นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรเป็นตัวทำละลายหรือสารกลาง สนับสนุนกระบวนการสังเคราะห์ที่มีประสิทธิภาพ ในงานวิจัยและพัฒนา ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมีอินทรีย์สำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อน นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์สำหรับการทำความสะอาดและการ etching กระบวนการ โดยอาศัยความเสถียรทางเคมีและความผันผวนที่เหมาะสม