Naftifine-d3 hydrochloride ถูกใช้ในการวิจัยทางการแพทย์และเภสัชวิทยา เพื่อศึกษากลไกการทำงานและการเผาผลาญของยา Naftifine ซึ่งเป็นยาต้านเชื้อรา โดยการใช้สารนี้ช่วยให้นักวิจัยสามารถติดตามและวิเคราะห์การกระจายตัวและการเปลี่ยนแปลงของยาในร่างกายได้อย่างแม่นยำมากขึ้น เนื่องจากมีอะตอมของดิวเทอเรียม (deuterium) แทนที่ไฮโดรเจนในโมเลกุล นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาวิธีการวิเคราะห์ทางเคมีและชีวภาพ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความแม่นยำในการตรวจวัดระดับยาในตัวอย่างทางคลินิก