ไซโคลเพนเทน-1,3-ไดคาร์บอกซิลิกแอซิดถูกใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยมีบทบาทสำคัญในการผลิตยาต่างๆ ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารเคมีเฉพาะทาง รวมถึงโพลีเมอร์และเรซิน เนื่องจากความสามารถในการนำเสนอโครงสร้างเฉพาะเจาะจงสู่ผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสร้างสารเคมีละเอียดและสารเคมีเกษตร โดยใช้คุณสมบัติไดคาร์บอกซิลเพื่อปรับเปลี่ยนหรือเสริมคุณสมบัติของโมเลกุลเป้าหมาย ความหลากหลายในการทำปฏิกิริยาทางเคมีทำให้มีคุณค่าต่อกระบวนการวิจัยและอุตสาหกรรม