ใช้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์เพปไทด์ โดย Cyclo(L-Ala-L-Pro) ทำหน้าที่เป็นตัวเลียนแบบไดเปปไทด์ที่มีข้อจำกัดทางโครงสร้างคอนฟอร์เมชัน ซึ่งช่วยรักษาโครงสร้างรองเฉพาะเจาะจงในเพปไทด์และเพปไทด์โทมิมิติกที่ออกแบบไว้ ถูกนำมาใช้ในเคมียารักษาเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพของยาที่มีฐานเป็นเพปไทด์ โครงสร้างวงแหวนที่แข็งตัวของมันมีผลต่อเรขาคณิตของโครงสร้างหลัก ทำให้มีประโยชน์ในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) และในการพัฒนาสารชีวภาพที่มุ่งเป้าไปที่เอนไซม์และตัวรับ นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการศึกษาลำดับโมติฟที่อุดมด้วยโพรลีนในโปรตีนและในการออกแบบโฟลเดอร์เมอร์