BOC-PHE-GLY-OME ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะสารกลางที่ได้รับการป้องกัน มันทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยสำหรับการสร้างสายเปปไทด์ที่ใหญ่กว่า โดยรับประกันว่ากรดอะมิโนเฉพาะจะถูกนำเข้าในตำแหน่งที่ต้องการ กลุ่ม BOC (tert-butyloxycarbonyl) ปกป้องส่วนประกอบของอะมีนในระหว่างการสังเคราะห์ ป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการ ในขณะที่เอสเทอร์เมทิล (OME) ปกป้องกลุ่มคาร์บอกซิล สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) และการสังเคราะห์แบบเฟสของเหลว ทำให้สามารถผลิตเปปไทด์ด้วยความแม่นยำและความบริสุทธิ์สูง การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนายา เปปไทด์ชีวภาพ และเครื่องมือวิจัยสำหรับศึกษาการโต้ตอบและหน้าที่ของโปรตีน