ฟูรามิดีน ไดไฮโดรคลอไรด์ถูกนำมาใช้หลักในการวิจัยทางชีวการแพทย์เนื่องจากคุณสมบัติต้านปรสิตที่แรง มันได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางสำหรับประสิทธิภาพในการต่อสู้กับโรคทริพาโนโซมิเอซิสแอฟริกา หรือที่รู้จักกันในชื่อโรคหลับ อันเกิดจาก Trypanosoma brucei สารนี้ทำงานโดยการจับกับดีเอ็นเอของปรสิต ยับยั้งการสืบพันธุ์และนำไปสู่การตายของเซลล์ นอกจากนี้ยังแสดงศักยภาพในการต่อสู้กับการติดเชื้อปรสิตอื่นๆ เช่น เลชมาเนียสิส นักวิจัยยังกำลังสำรวจศักยภาพของมันในฐานะยารักษาโรคมะเร็ง เนื่องจากความสามารถในการรบกวนกระบวนการดีเอ็นเอในเซลล์ที่แบ่งตัวอย่างรวดเร็ว การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปสู่ชีววิทยาโมเลกุล ซึ่งใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาการโต้ตอบของดีเอ็นเอและกลไกการทำงานในระบบชีววิทยาต่างๆ