Diprotin B ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางเภสัชวิทยาและชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในการศึกษากระบวนการยับยั้งเอนไซม์ dipeptidyl peptidase IV (DPP-IV) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมระดับน้ำตาลในเลือดโดยการย่อยสลายฮอร์โมน incretin เช่น GLP-1 การยับยั้ง DPP-IV ช่วยเพิ่มการหลั่งอินซูลินและลดการสลายฮอร์โมน GLP-1 ซึ่งเป็นประโยชน์ในการพัฒนายารักษาโรคเบาหวานประเภท 2 นอกจากนี้ Diprotin B ยังถูกใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และปฏิกิริยาทางชีวเคมีที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการเมตาบอลิซึมของร่างกาย รวมถึงการวิจัยในด้านภูมิคุ้มกันวิทยาและมะเร็ง