เอทิลมาโลนิล-โคเอ (Ethylmalonyl-CoA) มีบทบาทสำคัญในเส้นทางการเผาผลาญ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ชีวภาพของโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน มันเป็นตัวกลางสำคัญในเส้นทางเอทิลมาโลนิล-โคเอ ซึ่งถูกใช้โดยแบคทีเรียบางชนิดในการดูดซึมสารประกอบคาร์บอน เช่น อะซิติล-โคเอ เส้นทางนี้จำเป็นสำหรับการผลิตส่วนประกอบพื้นฐานที่ต้องการสำหรับการเจริญเติบโตของเซลล์และการผลิตพลังงาน

ในการบิโอเทคโนโลยี เอทิลมาโลนิล-โคเอ มีความสำคัญสำหรับการผลิตเชื้อเพลิงชีวภาพและพลาสติกชีวภาพ มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์โพลีไฮดรอกซีอัลคาโนเอท (PHAs) ซึ่งเป็นโพลิเมอร์ย่อยสลายได้ทางชีวภาพที่ใช้ในพลาสติกที่เป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ การมีส่วนร่วมในวิศวกรรมเมแทบอลิซึมช่วยให้สามารถพัฒนาสายพันธุ์จุลินทรีย์ที่ปรับให้เหมาะสมสำหรับการผลิตสารเคมีและยาที่มีค่าอย่างมีประสิทธิภาพ

ในการวิจัย เอทิลมาโลนิล-โคเอ ถูกใช้ในการศึกษเส้นทางการเผาผลาญและหน้าที่ของเอนไซม์ ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกระบวนการชีวเคมีของจุลินทรีย์ ความเข้าใจนี้ช่วยในการพัฒนาการประยุกต์ใช้บิโอเทคโนโลยีใหม่และการปรับปรุงกระบวนการหมักอุตสาหกรรม