3-Methoxy-2-cyclopenten-1-one ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการผลิตยา เกษตรเคมี และเคมีภัณฑ์ละเอียด มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนเนื่องจากโครงสร้าง cyclopentenone ที่ทำปฏิกิริยาได้ง่าย ใช้ในการพัฒนาสารประกอบกลิ่นหอม ซึ่งช่วยสร้างโปรไฟล์กลิ่นที่เป็นเอกลักษณ์ในน้ำหอมและเครื่องสำอาง นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเพื่อสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ กลุ่มเมทอกซี่ของมันช่วยเพิ่มความทำปฏิกิริยา ทำให้มีคุณค่าในกระบวนการแปลงเคมีต่างๆ