ใช้เป็นสารตั้งต้น chromogenic ในชีววิทยาโมเลกุลและจุลชีววิทยาสำหรับการตรวจจับกิจกรรมของเอนไซม์ β-glucuronidase (GUS) การประยุกต์ใช้หลักคือในวิศวกรรมพันธุกรรม โดยเฉพาะการศึกษาการแปลงพันธุกรรมพืช ซึ่งยีนรีพอรเตอร์ GUS ถูกนำเข้าไปในสิ่งมีชีวิต เมื่อเอนไซม์ β-glucuronidase ถูกแสดงออก มันจะตัดพันธะ glucuronide ปล่อยสีย้อมอินดิโกสีน้ำเงินที่ไม่ละลาย 6-chloro-3-hydroxyindole ซึ่ง dimerizes และ oxidizes อย่างรวดเร็วเพื่อก่อตัวเป็นตะกอนสีน้ำเงินที่มองเห็นได้ ทำให้สามารถมองเห็นรูปแบบการแสดงออกของยีนในเนื้อเยื่อได้ง่าย รูปแบบเกลือ cyclohexylammonium ปรับปรุงความละลายและความเสถียรในสารละลายน้ำ ทำให้เหมาะสำหรับการย้อม histochemical นอกจากนี้ยังใช้ในการตรวจจับอย่างรวดเร็วของแบคทีเรียก่อโรค เช่น Escherichia coli O157:H7 ในตัวอย่างอาหารและคลินิก โดยที่กิจกรรม GUS เป็นตัวบ่งชี้สำหรับการระบุตัวตน