โซเดียมเมอร์แคปโตไพรูเวตถูกใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการศึกษากระบวนการเมแทบอลิซึมของซัลเฟอร์และกลไกการกำจัดสารพิษในร่างกาย นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาและสารประกอบเพื่อรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการสะสมของสารพิษหรือความผิดปกติของกระบวนการเมแทบอลิซึม เช่น โรคทางพันธุกรรมบางชนิด นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประยุกต์ใช้ในด้านการเกษตรเพื่อปรับปรุงการเจริญเติบโตของพืชและเพิ่มความทนทานต่อสภาวะเครียดอีกด้วย