Chymotrypsinogen A ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีและการแพทย์ ในงานวิจัย ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นของ chymotrypsin ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่ย่อยโปรตีน ทำให้มีคุณค่าในการศึกษาการย่อยโปรตีนและจลนศาสตร์ของเอนไซม์ ในทางการแพทย์ ใช้ในกระบวนการรักษา โดยเฉพาะการดูแลบาดแผลและลดการอักเสบ ซึ่งรูปแบบที่ถูกกระตุ้น chymotrypsin ช่วยย่อยเนื้อเยื่อที่เสียหายและส่งเสริมการสมานแผล นอกจากนี้ ยังใช้ในขั้นตอนการวินิจฉัยบางอย่างเพื่อวิเคราะห์โครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน บทบาทในการอำนวยการย่อยโปรตีนยังทำให้มีประโยชน์ในกระบวนการอุตสาหกรรม เช่น การผลิต hydrolysates โปรตีนสำหรับอาหารเสริมโภชนาการ