โปรตีเนส K สารละลายถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในการสกัดและทำความสะอาด DNA และ RNA จากตัวอย่างทางชีววิทยา เนื่องจากมีประสิทธิภาพสูงในการย่อยสลายโปรตีนที่ปนเปื้อน ทำให้ได้สารพันธุกรรมที่บริสุทธิ์และมีคุณภาพดี นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการเตรียมตัวอย่างสำหรับเทคนิคต่างๆ เช่น PCR, Southern blot และ Northern blot เพื่อเพิ่มความแม่นยำและประสิทธิภาพของผลลัพธ์ การใช้งานในทางนิติวิทยาศาสตร์ก็มีความสำคัญ โดยใช้ในการแยก DNA จากตัวอย่างที่ซับซ้อน เช่น เลือดหรือเนื้อเยื่อ เพื่อการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม