PFI-3 ถูกนำมาใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะตัวยับยั้งที่แรงและเลือกเฉพาะต่อตระกูลโปรตีน BRPF (Bromodomain and PHD Finger-containing) โดยเฉพาะอย่างยิ่ง BRPF1, BRPF2 และ BRPF3 การประยุกต์ใช้มีบทบาทสำคัญในการศึกษาบทบาทของโปรตีนเหล่านี้ในการปรับโครงสร้างโครมาตินและการควบคุมยีน นักวิจัยใช้ PFI-3 เพื่อตรวจสอบผลกระทบต่อเส้นทาง epigenetic โดยเฉพาะในบริบทของมะเร็งและโรคอื่นๆ ที่โปรตีน BRPF มีส่วนเกี่ยวข้อง โดยการยับยั้งโปรตีน BRPF, PFI-3 ช่วยในการทำความเข้าใจหน้าที่ทางชีวภาพและศักยภาพในฐานะเป้าหมายการรักษา นอกจากนี้ ยังใช้ใน assays เซลล์และการศึกษา in vitro เพื่อสำรวจผลกระทบต่อการ acetylate ฮิสโตนและการควบคุมการถอดรหัส ให้ข้อมูลเชิงลึกในการพัฒนาการบำบัด epigenetic ใหม่