FTO-IN-2 ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษาการยับยั้งโปรตีน FTO (Fat mass and obesity-associated protein) ซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมกระบวนการเมทิลเลชันของ RNA และการเผาผลาญพลังงานในร่างกาย การวิจัยนี้มีศักยภาพในการพัฒนายาต่อต้านโรคอ้วนและโรคเบาหวาน เนื่องจาก FTO มีบทบาทสำคัญในการควบคุมน้ำหนักตัวและระดับน้ำตาลในเลือด นอกจากนี้ FTO-IN-2 ยังถูกใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษากลไกการทำงานของ FTO ในระดับโมเลกุล เพื่อทำความเข้าใจกระบวนการทางชีววิทยาที่เกี่ยวข้องกับโรคเมตาบอลิซึมมากขึ้น