ไซโคลเฮกซีนออกไซด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตโพลีออล ซึ่งเป็นส่วนประกอบสำคัญในการผลิตโฟมโพลียูรีเทน สีเคลือบ และกาว นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารเคมีพิเศษ เช่น พลาสติไซเซอร์ สารลดแรงตึงผิว และสารหล่อลื่น ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ยาบางชนิดและโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ เนื่องจากวงแหวนเอพอกไซด์ที่ทำปฏิกิริยาได้ ความหลากหลายของมันยังขยายไปสู่ภาคเกษตรกรรม ซึ่งช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ความสามารถในการทำปฏิกิริยาและความเสถียรของไซโคลเฮกซีนออกไซด์ทำให้เป็นส่วนประกอบหลักในเคมีอินทรีย์และการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม